在第4次十字军东征后,威尼斯变成拉丁帝国的一部分,由君士坦丁堡(拉丁帝国在1204年占领了君士坦丁堡)来管辖。威尼斯则扩展它影响力,建立了爱琴群岛公国(Duchy of the Archipelago)。当土耳其人在曼赞克尔特战役(Battle of Manzikert)中打败拜占庭帝国后,这可能是君士坦丁堡对威尼斯具有决定性影响力的最后时刻。虽然拜占庭帝国在半世纪后重新掌握这座城市的控制权,不过当时国势已经相当衰弱了。奥斯曼帝国的穆罕默德二世在1453年占领了这座城市。而从拜占廷帝国劫掠来的许多财宝被带回威尼斯,其中也包括威尼斯的象征-圣马克飞狮。
威尼斯的行政架构与古罗马共和的系统相似,由一位被选出来的行政官(公爵)、一个类似参议院,由贵族组成的机构及许多拥有部分政治权力的公民所构成的,公民原先拥有权利去同意或拒绝每位新选出来的公爵。教堂与许多私人建筑是做为军事使用,虽然威尼斯没有终身职的骑士。圣马克骑士(Cavalieri di San Marco)是唯一在威尼斯存在过的骑士阶层,没有任何一位公民可以接受外来的命令而没有政府的同意。在独立时期,威尼斯仍然保持共和,政治与军事是完全的分离,除了在偶发状况下,公爵可以统御军队。就其它意义而言,战争代表商业的附属品。因此,威尼斯早期制造了大量的雇员,来为任何地方服务,后来当统治阶层占有商业时,依靠着这些外来的雇员。